Syventävän vaiheen koulutuksiin edellytetään hyväksyttyä Shindo® -ohjaajan koulutusta. Kurssin kesto on noin kaksi lukukautta, yhteensä 12 koulutuspäivää.
Syventävä kurssi on tärkeä shindo-harjoittelun vaihe. Silloin kerrataan ohjaajakurssin sisältöä, opitaan uusia tekniikoita, valmistaudutaan mahdolliseen kouluttajakoulutukseen ja nautitaan myös vapaammasta perustekemisestä. Luodaan omaa ”käsialaa” ja harjoitellaan syvempää hoitamisen otetta sekä asentoa/asennetta. Kurssin sisältönä on useita uusia hoitotekniikoita, venytysten syventämistä, sovellutuksia ja mm. apuohjaajana toimiminen ryhmissä.
Jakso ei vielä anna oikeuksia hoitotyöhön tai ohjaajakoulutuksen antamiseen.
Syventävää koulutusta voivat antaa koulutustiimin jäsenet.
Myös syventävään vaiheeseen kuuluu näyttökoe ja tämän vaiheen suorittaminen on edellytys kouluttaja-/hoitajakoulutukseen hakeutumiselle. Syventävän jakson näyttökokeen ottavat vastaan vastaavat kouluttajat.